Le contrôle de la qualité de la Tête de Moine AOP s'effectue selon les exigences définies par le cahier des charges. Une fois par mois, une «taxation» (test de qualité) est réalisée. Les experts jugent la qualité des fromages d'après quatre critères : l'aspect extérieur, les ouvertures dans la pâte, la texture de la pâte (sa couleur, sa raclabilité), et bien sûr l'odeur et le goût du fromage.
Les fromages dont la qualité est insuffisante ne pourront pas être commercialisés sous la dénomination Tête de Moine AOP.